从启二年开始建立师范学堂后，前期是一年就毕业，朱由校想等到教师基本上满足后再实行两年的学制。但一直到启八年，依然是一年学制，因为根本就没有教师满足的时候。
启四年，在南直隶开办了南京师范学堂，在四川开办了成都师范学堂。启五年，在陕西开办了西安师范学堂，在湖广开办了长沙师范学堂。启六年，在广东开办了广州师范学堂，在福建开办了泉州师范学堂，在山东开办了临清师范学堂。启七年，山西开办了太原师范学堂，河南开办了洛阳师范学堂。
启三年毕业的那一届学生，在分配到各处学堂后，很多人都在启四年被朝廷重新召回，然后再派到了各地的师范学堂担任教师。在师范教育中，对民族的认同感教育是第一位的，第二位就是官话的学习了。所有的师范生必须得一口流利的官话，当然是北京官话而不是凤阳官话。而且要求在任教时必须用官话教学，使学生至少要能听懂官话。
启七年九月，朝廷将教育这一块从礼部划拉出来，正式成立了教育部，部长便是原京师大学堂师范学堂的副校长杨鹤。这人打仗不大行，但是抓教育确实是一把好手。各地师范学堂的建设和人员配置基本上是他负责的，事后无论是厂卫还是廉政公署，都称赞其“账目清楚明白，无一毫错处。任用均以才德论，无有一例徇私。”
朱由校已经命令翰林院在听取各方意见后制定了《教育法》，《教育法》规定，每年的教育经费，均由户部按一年的税收总额按比例拨款。启八年到二十年为每年税收总额的一成，然后再根据情况来决定是增加还是减少。
这个拨款数额已经算是非常非常高的了，因为全国的学堂本来就不多，中学堂更是只有十来所，所以大量的钱便被用来兴修学堂。朱由校对杨鹤的要求是五年之内，各个布政司至少要有一所师范学堂，北京和南京要有两所。每个乡必须保证要有一所学堂，每个县要保证有一所中学堂。
《教育法》规定，所有年龄六岁到十五岁的大明男子或女子，均可以免费在国立学堂学习两年，如成绩优异，则可以继续免费在国立中学堂学习两年。而其中成绩优异者，则可推荐入京师大学堂或各省师范学堂学习。
这个成绩优异，只能是按考试成绩。所有弄虚作假的学生将永远被免除进入大明学堂的机会，并且追缴前面免费学习阶段学费的十倍，而参与作假的教师则永远开除教师资格并入狱十年。
《教育法》对教师和学生的要求也非常严格，里面有繁多的教师师德规范，象不得收受学生及家长礼物，象不得击打学生『臀』部及手掌以外的部位或导致其受伤，象不得对学生收取任何费用或者利用教师身份获得任何好处……教师只要有违反师德规范的行为都会被永远取消教师资格，并且会根据情况决定是否追究其刑事责任。
每个学堂都会邀请地方的开明士绅及有威望的人士组成学堂董事会，董事没有薪资，权力却极大，专门负责监督学堂的各项行为，能够对上级教育机构提出自己的建议和意见。有这样一个机构对学堂进行监督，应该可以使教学环境更加纯净，教师也不敢有太多出格的行为。
而学生中凡属有忤逆教师管教行为的，无论是言语还是行动，都会被永远开除学生资格，并记录在案，不得参与大学堂的入学考试及科举考试。欺压同学的行为也会被直接开除，若是年满十二岁，则会被送入辽东农场进行一年的劳动改造。
朱由校看到这个《教育法》草稿的时候，觉得对学生要求实在太严格了。觉得应该给学生一个改正错误的机会，却遭到了群臣的一致反对。叶向高认为，一个教师爱学生，学生爱老师的学堂，才能培育出真正对大明有用的人才。一个学生如果对教师都忤逆，对同学都期压，那这个学生根本就不配读圣贤书。
朱由校喃喃地道：“难道我们不应该让学生快乐地学习吗？这样的学校不会压抑他们的『性』吗？”
叶向高笑道：“陛下，学习本来是掌握技能的过程，也许有些人在学习中是快乐的，但那应该只有极少数，在这殿中的我想应该不多。白首穷经通秘义，这读书之事，本来便是苦事，何来快乐之言。”
朱由校不死心地道：“日后我们在全国各地都建立了足够多的学堂，所有的学生都会进入学堂，中学堂里学习。总有些人是不愿意学习的，那时怎么办呢？”
叶向高道：“要到这一，不知还要多少年，老臣是看不到的了。只是老臣觉得，学堂便是掌握基本的书写和算术方法的，这当然最后要让所有人都懂才校但中学是为大学选拔人才的，为什么要所有人都进中学堂学习呢？有些人『性』便不爱读书，那我们让他们懂得民族大义，知道要爱华夏，爱大明，爱陛下便可，会写自己的名字，会看看书报便可，简单地算数记账，不会受到商人欺负便可，何必要学那么深呢？对他们又有什么好处呢？”
朱由校道：“可是到了那个时候，你即使是种田，还是做什么事都要一定的技能，而中学堂便是学习其原理的时候，不学又如何能够在这世上立足呢？”
徐光启上前道：“陛下，掌握某项技能，并不一定需要知道原理的。象我们的钢厂，那工人只需要知道自己应该做什么，如何做就行了，而炼钢的原理要知道做什么呢？学堂学习之后，便可以在钢厂先实习一段时间，然后就懂得了流程，自然就成为了一个合格的钢厂工人了。”
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