1993年7月，乔丹的父亲詹姆斯·乔丹被不法分子枪杀，乔丹因此深受打击。他于1993-94赛季训练营开始以前宣布爆炸性新闻，选择从NBA退役。当时他只有三十岁，正值巅峰（球员巅峰大概是28-32岁）。
乔丹在篮球界没了目标，转而去挑战职棒赛场。不过一年多的惨痛经历使他明白，某个领域的神到了另一个领域，并不一定能取得成功。
1993-94赛季，皮蓬单独带队杀进季后赛，东部半决赛与尼克斯再度大战七场，这次尤因的尼克斯取得了胜利。皮蓬当赛季入选了最佳阵容一阵、最佳防守阵容一阵并收获到了全明星赛MVP。
1994-95赛季芝加哥公牛队搬迁到新场馆联合中心球馆。赛季中期，从职棒赛场遭遇挫折的篮球之神选择回归属于他的领域，随队杀进了季后赛。在仅打的17场常规赛中，乔丹场均能收获15.7分5.4篮板4.6助攻。东部半决赛中，公牛队遇到奥尼尔和便士率领的魔术，意外遭到淘汰。
魔术队成了公牛三连冠后唯一在季后赛淘汰过乔丹的球队。
1995年夏天，乔丹经过苦练找回状态，带领公牛杀回季后赛。他当赛季斩获常规赛和全明星MVP，收获得分王。
公牛队强势杀回总决赛，六场击败西雅图超音速，乔丹获得个人第四次总决赛MVP，强势宣布正式归来。
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