之后在启程之风！无尽的道路!!至小智与拉帝欧斯！，小智和皮卡丘在旅途中又经历了不少事情：在森林中救下受伤的拉帝亚斯；和以前的伙伴小霞争夺铁臂枪虾；和天桐一起将小刚从布莉姆温施放的幻象中解救出来并化解了误会；和杰尼龟消防队一起扑灭了仓库街的大火，救出被困的宝可梦；和拉普拉斯等宝可梦一起救出被卡在洞穴中的吼吼鲸；帮助诅咒娃娃找回它曾经的训练家；摧毁火箭队三人组全员集结捕捉皮卡丘的计划；帮助拉帝亚斯救出拉帝欧斯，打败宝可梦猎人。
在彩虹和宝可梦大师！中，回到真新镇的小智在帮助大木博士寻找走失的小火龙时和小茂重逢，面对小茂所问的“成为冠军之后距离宝可梦大师还有多远”这一问题，小智陷入了思考。
和皮卡丘一起躲雨时，小智找到了自己的答案。“成为冠军并非终点，我依然还是一个挑战者；我想和全世界的宝可梦成为朋友，这样一定就是宝可梦大师”，对于何为真正的宝可梦大师，小智给出了这样的回答。雨过天晴，小智看着眼前的彩虹，露出了笑容，坚定了心中的信念，和皮卡丘约定即使成为宝可梦大师也要一直在一起。
之后，小智换上了花子给的新鞋子，和皮卡丘一起，朝着成为心中向往的宝可梦大师的目标，再次踏上无尽的旅途。 至此，以小智和皮卡丘为主角的冒险故事正式告一段落，但他们的冒险仍将继续下去。
它为了保护常青森林的波波和比比鸟进化成了大比鸟，并打败烈雀与大嘴雀群。成为了常青森林的波波和比比鸟的队长，为了继续保护同伴们，离开小智。在小智成为宝可梦世界锦标赛冠军后，因波波和比比鸟已经拥有了自保能力，选择回归小智队伍。
已知招式有起风、电光一闪、吹飞和舍身冲撞。
开宝可梦乡的少女为了妙蛙种子能够增加经验，让小智将其收服带走。EP50曾有机会进化成妙蛙草，但是拒绝进化，并学会了绝招日光束。EP226中妙蛙种子回到了大木研究所，成为维持周边宝可梦和谐相处的守护者。之后更曾参加城都联盟和对战开拓区的比赛。 已知招式有藤鞭、飞叶快刀、寄生种子和日光束。 曾用招式有撞击、催眠粉、猛撞和挖洞。
一只舍身保护被凯罗斯们攻击的巴大蝶的赫拉克罗斯，被小智救出后，跟随并帮助小智等人来带凯罗斯的森林，击败火箭队。自愿跟随小智，被小智收服。小霞不讨厌的虫宝可梦之一，性格温顺，喜欢吸食树枝和妙娃种子身上的树汁，多次参加联盟比赛，也参加过对战开拓区的比赛，是小智的虫系王牌。 已知招式有角撞、超级角击、梦话和破坏光线。 曾用招式有撞击、挺住、瞪眼、猛撞、乱击和真气拳。
它是库库伊博士家里的宝可梦。SM015中，它由于自身习性的原因，在夜晚跑到爪痕之丘，与那里的野生宝可梦对战，但因为没有办法成功使出落石而输给了鸭嘴火兽，小智回到家后发现了满身是伤的它。在小智得知它输给鸭嘴火兽以后，决定帮助它进行招式特训。事件结束之后，库库伊博士在海边将它送给了小智。在阿卡拉岛时，由于极为罕见的绿闪光现象而进化成了从未被发现的全新形态的鬃岩狼人，瞳孔的颜色也随之转变为绿色。因为是在黄昏时进化而成，而被博士命名为鬃岩狼人 黄昏的样子。它非常爱干净，一旦身上被弄脏，眼睛就变为红色，愤怒得失去理智，就连小智的命令都不听。这个毛病在SM075中得到控制。 阿罗拉联盟决赛，鬃岩狼人击倒格拉吉欧的鬃岩狼人，帮助小智实现首个联盟冠军。 阿罗拉联盟表演赛，鬃岩狼人被库库伊博士的勇士雄鹰打败。 已知招式有落石、冲岩、尖石攻击和双倍奉还。 曾用招式有撞击和咬住。 已用过的Z招式为究极无敌大冲撞、毁天灭地巨岩坠、狼啸石牙飓风暴。
根据火斑喵的梦境，在很久以前，火斑喵曾经流离失所，后来被野生的长毛狗所救，而彼此相处，但是，随着长毛狗的年事已高，无法自行觅食后，火斑喵便时常帮长毛狗在街头寻找食物带回去给它吃。而长毛狗于SM021中逝世。SM063中进化为炎热喵。 阿罗拉联盟半决赛，炎热喵成功击倒古兹马的巨钳螳螂，后被古兹马的具甲武者打败。 阿罗拉联盟表演赛，炎热喵成功打败一直为目标的炽焰咆哮虎。后进化炽焰咆哮虎耗尽体力昏厥。 已知招式有火焰牙，蓄能焰袭、报复和大字爆炎、ＤＤ金勾臂。 曾用招式有火花、抓。 已用过的Z招式为究极无敌大冲撞、超强极限爆焰弹。
耿鬼隐身潜入樱木研究所到处恶作剧，在被来电汪察觉后逃走。小智、小豪和樱木博士等人在研究所内展开搜查，但小豪丢向它的精灵球全被它用精神强念弹开，它强大的实力也让皮卡丘和炎兔儿陷入苦战并再次顺利脱逃。 耿鬼又一次在研究所里恶作剧，给小智等人带来了许多麻烦。在樱木博士和来电汪赶到后，它躲进了小智的影子里，并对他恶作剧，使小智无论做什么事都会变得非常倒霉。火箭队找到耿鬼打算拉拢它，耿鬼不愿，他们就将耿鬼抓了起来。千钧一发之际，小智和皮卡丘及时赶到救了耿鬼，小智说服耿鬼与他并肩作战，成功击退了火箭队和他们的两只彷徨夜灵，可就在这时小智却因为疲劳昏倒了。小智苏醒后询问耿鬼的情况，这时，隐身的耿鬼先后丢给了它一颗苹果和一个精灵球，现身示意想要成为小智的宝可梦。于是，小智成功收服了耿鬼。 特性为诅咒之躯。 已知招式有暗影球、魔法闪耀、污泥炸弹、鬼火。 曾用招式有黑夜魔影、精神强念、冰冻拳。 已知极巨招式有极巨酸毒、极巨寒冰、极巨妖精、超极巨幻影幽魂。
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