这次秦刚还动用了一支准备已久的特殊部队：医患队。
这也是熙宁宋越之战最为惨痛的教训之首，在那场战斗中，真正的战斗死伤并不多，绝大多数的减员都来自于西军士兵在进入交趾山林之地后，受当地的瘴气影响，因此患病伤亡的士兵最终是十倍于前者。
最终，在交趾朝廷坚持不住想要止兵和谈的时候，实际上当时的郭逵也基本坚持不下去了，所以才会有他一句“愿以一身活十余万人命”，同意了撤兵。
秦刚心里清楚，所谓的“瘴气”，其实只是受当时医疗认知的不足，对于在热带雨林气候之下易生的疟疾、痢疾、脚气、沙虱、出血热、黄疸等等各种疾病的一种统称，而其中核心病症为疟疾，根本原因主要是出于北方士兵骤然南下，休息不足，潮气侵袭，从而导致身体抵抗力下降。
所以，秦刚为此作了三手准备：其一，流求唐州格致院医药所，早就开始了对于南方疟疾的治疗研究，并从历代中医典籍及经验中，总结研制出了极高效的治疟药方，并完成了足够的战备准备；其二，也是从格致医药所的研究中，总结并制订了南方行军的生活要则，其中包括不喝生水、普及打绑腿、营地灭蚊虫、厕所挖制条例等等，尽数下达到水师部队的官兵之中，详加介绍，要求严格执行；其三，也是最重要的，就是组建了专门的医患队，除了从格致院里专门抽调了一些医生之外，有些以往参加过战斗，加上一些轻伤不便再上战场的老兵等组成。以往的战斗中往往也会设有此营，但大多只是因战而设，没有具体的编制，更不用说是部队营号。
但是，秦刚自此战准备之初始，就反复强调过对越作战的伤病管理的重要性，明确建营，并正式命名为“火凤营”，象征凤凰浴火重生之意。
而火凤营的负责人，既让大家意外、又想想当然，便就是赵驷刚娶回家的秦婉。
原本赵驷是不同意的，他怎么忍心让自己的娇妻去上战场，又是去处理此等血肉横飞的场景呢？
但是秦婉却说：“驷哥你在外领兵打仗，婉儿在家也是坐立不安。若是随军而行，便是离着驷哥你更近，若有意外，我也能第一时间在旁；再说了，刚哥自西军设立伤患营起，便就是我在打理，要说管理，我比任何人更合适，也更能让他放心。你要再加阻拦，我便直接去找他告状去！”
赵驷无奈，只能从自己身边挑了四个亲兵，调他们也去火凤营，专门负责帮他照看并保护好秦婉。
在武器装备方面，秦刚还是刻意对朝廷隐瞒了流求的火炮研发与应用进展情况：
火炮兵并没有在东南水师中设立，战舰的装备以及战法仍然是以床弩与抛石机远程攻击，旋风炮加轰天雷近身轰炸为主。而对于装备了船载火炮并进行火炮作战的流求水师，一旦有人关注并议论起时，也对外统一解释为，这些火炮只是用巨响威吓敌人，或者是在海上用巨大的声响进行大范围的沟通联系所用。
所以，此战同样也是以兵力不足的理由，再次向流求方面租借了一支舰队共十二艘装备有火炮的战船。
在东南海事院频繁的军令与混迹于南来北往的商船调度中，一个月的时间很快就过去了，此时已经进入建中靖国元年的十一月。
而冬季，无论是风向、还是天气，都是最适合向南洋一带行军用兵的。
一个月的准备时间，在秦刚看来，已经是拖延已久的节奏，令他对于此时南征之战的保密性以及是否会意外被交趾方获知的担忧又增加了几分。
事实上，秦刚的这份担忧是根本没有必要的。
此时的信息传递速度，远非后世所能相比，而任何一方的谍报工作，也远远未能达到后世的百分之一。
熙宁那次的宋军伐越，朝廷是在熙宁八年冬月接到钦州、廉州被越交趾军队攻破，邕州被围的消息，然后邕州在被围四十二天后终被攻破。宋朝廷这时才于次年二月发布《讨交趾敕谕》，宣布调兵南讨。但是为了聚集起十万大军，并妥善解决背后的粮草、物资，一直等到郭逵带领西军主力赶到广南西路，正式与交趾军交手时，已经是近八个月后的十月份了。
所以，依照以往的惯例，从交趾这边来看，即使是他们的谍报人员打探到了宋朝廷已获知了广南西路大量地方被他们蚕食的事实，但是他们认为，宋朝一定会在内部展开激烈而漫长的“是战是和”的争论。即使是这场争论是以“主战派”胜出而决定要讨伐他们的话，至少还得要有大半年的时间，所以交趾觉得，他们根本不需要担心战事的快速到来。
比如可以去装样子朝贡一下，力求说明这只是一场误会，在不重要的地方服个软，说几句好话，再象征性地退让一两处的地方，那么兵戎相见的局面就不大会出现。
而即使是双方谈不拢条件，将大宋彻底激怒，那就可以先去看着所谓的再次讨伐的敕谕出来后，也一样还会有着七八个月的备战时间。
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